La côte pacifique abrite des lagons où se reproduisent les baleines grises (Scammon’s lagoon, San Ignacio Lagoon et Magdalena Bay).

Le golfe de Californie, aussi connu sous les noms de mer de Cortez (Mar de Cortés en espagnol, qui est le nom le plus utilisé par les riverains) et mer Vermeille (Mar Bermejo) est une mer de l'océan Pacifique qui sépare la péninsule de Basse-Californie du Mexique continental. À son extrême nord se trouve l'embouchure du fleuve Colorado. Il est entouré par les États mexicains de Basse-Californie, Basse-Californie du Sud, Sonora et Sinaloa.

La zone est inhabituelle parce qu'elle est aussi bien une aire de reproduction que d'alimentation des cétacés. De nombreuses espèces peuvent y être observées.