Le globicéphale noir est essentiellement rencontré dans la zone pélagique, au-delà du plateau continental et plus particulièrement sur les fonds de plus de 2 000 mètres, où plus de 70% des individus ont été observés. Dans le Sanctuaire, cette espèce semble surtout fréquenter le nord-ouest de la zone en période estivale. L’effectif moyen des groupes est d'une vingtaine d'individus.