En été, les rorquals à bosse fréquentent les eaux côtières du golfe et de l’estuaire. Au cours d’une même saison, ils peuvent se montrer très mobiles et être identifiés dans plusieurs régions du golfe: Minganie, Anticosti, Gaspésie et estuaire. Selon les observations du MICS, une augmentation de la fréquentation des rorquals à bosse dans le Saint-Laurent est observée depuis la fin des années 1990. Depuis 1999, les séjours des rorquals à bosse dans l’estuaire ont tendance à être plus nombreux et plus longs. Ces observations sont probablement en lien avec le rétablissement de la population : la taille de la population augmente, et les aires de distribution peuvent s’élargir, expliquant l’exploration de nouvelles aires d’alimentation.

Chaque printemps, plus de 7 500 rorquals à bosse quittent leur site de reproduction hivernal dans les Caraïbes et parcourent quelque 5 500 km pour rejoindre leurs aires d’alimentation dans l’Atlantique Nord et le Saint-Laurent. À l’automne, ils reprennent cette route vers le Sud. Ils passent l’hiver en gros rassemblements quasiment sans se nourrir, vivant sur leurs réserves de gras.